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《生物信息学简讯》:TIPS—一种对单细胞RNA测序结果深入分析的重要工具

发布时间:2021-11-26 | 浏览次数:

2021年9月2日,2020欧洲杯在线网投江山研究员与陆军军医大学万瑛教授、倪青山博士作为共同通讯编辑在生物学TOP期刊《生物信息学简讯》(Briefings in Bioinformatics, IF:11.622,中科院一区)发表研究论文,题目为:TIPS: trajectory inference of pathway significance through pseudotime comparison for functional assessment of single-cell RNAseq data。


研究建立了一种简单、高效的生物信息学分析方法:TIPS。该方法帮助研究者利用单细胞中获得的RNA序列信息数据(scRNAseq),分析寻找特定生物表型过程中的重要分子信号途径及参与的关键性转录因子(图1)。同时,TIPS的数据包可通过Web服务器运行,是帮助生物学家对单细胞RNA序列数据进行深入功能分析的重要工具。


图1.TIPS工作流程概述


研究成果得到以下项目支撑:国家重点项目(2017YFA0700404和2016YFA0502201);国家自然科学基金 (81971546);深圳市自然科学基金(JCYJ20190808150009605) 。


论文链接:https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab124/6255997


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